Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8BGC1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8BGC1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8BGC1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8BGC1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8BGC1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8BGC1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8BGC1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8BGC1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms