Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pknox2Q8BG99 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms