Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms