Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms