Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Smim19Q80ZU4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Smim19Q80ZU4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Smim19Q80ZU4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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