Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms