Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pnma8aQ80VM8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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