Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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Ttc29Q80VM3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc29Q80VM3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc29Q80VM3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc29Q80VM3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Ttc29Q80VM3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Ttc29Q80VM3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Ttc29Q80VM3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc29Q80VM3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc29Q80VM3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc29Q80VM3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc29Q80VM3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc29Q80VM3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Ttc29Q80VM3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc29Q80VM3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Ttc29Q80VM3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Ttc29Q80VM3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Ttc29Q80VM3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc29Q80VM3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Ttc29Q80VM3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc29Q80VM3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Ttc29Q80VM3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ttc29Q80VM3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ttc29Q80VM3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc29Q80VM3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ttc29Q80VM3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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