Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms