Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kcnf1Q7TSH7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnf1Q7TSH7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms