Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms