Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk40Q7TNL3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stk40Q7TNL3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms