Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sbno2Q7TNB8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms