Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms