Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Vma21Q78T54 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Vma21Q78T54 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Vma21Q78T54 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Vma21Q78T54 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Vma21Q78T54 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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