Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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