Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1cQ76I25 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms