Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms