Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms