Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms