Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms