Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms