Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NinlQ6ZQ12 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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