Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cnot1Q6ZQ08 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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