Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ino80Q6ZPV2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80Q6ZPV2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms