Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms