Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Cxcl3Q6W5C0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Cxcl3Q6W5C0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Cxcl3Q6W5C0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Cxcl3Q6W5C0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Cxcl3Q6W5C0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Cxcl3Q6W5C0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Cxcl3Q6W5C0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Cxcl3Q6W5C0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Cxcl3Q6W5C0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Cxcl3Q6W5C0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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