Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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