Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Bnip1Q6QD59 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bnip1Q6QD59 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bnip1Q6QD59 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bnip1Q6QD59 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bnip1Q6QD59 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Bnip1Q6QD59 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Bnip1Q6QD59 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bnip1Q6QD59 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bnip1Q6QD59 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bnip1Q6QD59 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bnip1Q6QD59 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bnip1Q6QD59 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bnip1Q6QD59 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Bnip1Q6QD59 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Bnip1Q6QD59 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Bnip1Q6QD59 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnip1Q6QD59 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnip1Q6QD59 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Bnip1Q6QD59 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Bnip1Q6QD59 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Bnip1Q6QD59 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Bnip1Q6QD59 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnip1Q6QD59 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnip1Q6QD59 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Bnip1Q6QD59 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnip1Q6QD59 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Bnip1Q6QD59 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnip1Q6QD59 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Bnip1Q6QD59 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Bnip1Q6QD59 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnip1Q6QD59 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnip1Q6QD59 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Bnip1Q6QD59 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bnip1Q6QD59 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bnip1Q6QD59 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Bnip1Q6QD59 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bnip1Q6QD59 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bnip1Q6QD59 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bnip1Q6QD59 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bnip1Q6QD59 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Bnip1Q6QD59 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Bnip1Q6QD59 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Bnip1Q6QD59 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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