Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms