Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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