Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms