Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms