Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C7

Znf728, Zinc finger protein 728, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf728Q6P5C7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Znf728Q6P5C7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Znf728Q6P5C7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Znf728Q6P5C7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Znf728Q6P5C7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf728Q6P5C7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Znf728Q6P5C7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Znf728Q6P5C7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Znf728Q6P5C7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Znf728Q6P5C7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Znf728Q6P5C7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Znf728Q6P5C7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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