Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxip1Q6NZQ4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxip1Q6NZQ4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms