Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms