Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms