Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms