Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms