Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms