Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTA4

Rragb, Ras-related GTP-binding protein B, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RragbQ6NTA4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RragbQ6NTA4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RragbQ6NTA4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RragbQ6NTA4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RragbQ6NTA4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms