Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc66Q6NS45 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms