Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mvb12bQ6KAU4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mvb12bQ6KAU4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms