Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt87Q6IMF0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms