Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt42Q6IFX2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt42Q6IFX2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms