Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6DFW0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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