Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk13Q69ZA1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms