Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

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Length 1,026 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms