Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fnip1Q68FD7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fnip1Q68FD7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms