Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4fQ66X05 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp4fQ66X05 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms